2000 год принес автомобилю Mustang более агрессивную внешность, у него появились новые фары и бамперы, капот также изменил свою внешность, воздухозаборники перед задними колесами стали более крупными, а колесные арки более выступающими. Знак, на котором изображен скачущий конь, обрамили в хромовый ободок, как на первом поколении автомобиля. Мотор модели также был немного изменен, теперь 4.6-литровый силовой агрегат имел 260 лошадиных сил и максимальную скорость 240 км/ч.
В 2003 году в Лас-Вегасе Форд вновь представляет свой новый автомобиль Mustang, который был сделан в честь десятой годовщины моделей со знаком SVT. Теперь Mustang SVT Cobra имеет два варианта кузова: кабриолет и купе. Произведено таких автомобилей будет всего 2003, как следует из цифры, количество моделей соответствует году, в котором он был сделан.
Автомобиль имеет 32-клапаный V8 двигатель объемом 4.6 литра мощностью 390 лошадиных сил принадлежащий семейству Triton, который форсирован за счет нагнетателя. У модели независимая задняя подвеска, а также у покупателя появилась возможность заказать модель с пятиступенчатой механической коробкой передач.
Учитывая, что Mustang SVT Cobra является юбилейной моделью, его можно отличить от других моделей по некоторым деталям. К примеру, его 17-дюймовые колесные диски со сдвоенной спицей выкрашены в золотистый цвет, за задних панелях и порогах можно увидеть надпись «10th anniversary», которая означает, что машина была сделана к 10-й годовщине, тут же нарисована кобра, стоящая в атакующей позе.
Кроме всего этого автомобиль имеет и необычные расцветки, которые не были предусмотрены у других моделей: Torch Red («Красный факел»), Black Clearcoat («Классический черный») и Silver Metallic («Серебристый металлик»). Сидения в салоне нового Ford Mustang имеют обивку красного цвета, а некоторые панели радуют глаз карбоновыми вставками, которые в наше время считаются очень модными.